補助金・経営支援顧問【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金
- 補助上限額
- 14万円
- 補助率
- 1/4
- 主な対象
- 設備整備・IT導入
【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金（医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業）の対象者、金額、対象経費、日程、注意点を、この制度の内容にそって整理しました。
この制度を一言でいうと
「【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金」は、医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業が実施する補助金・助成金です。対象の地域は東京都です。
○過年度に補助金の交付を受けた医療機関・薬局様へ 消費税及び地方消費税の仕入控除税額報告を受け付けております。 手引き及び申請書類を本ページ最下部の「詳細」よりダウンロードのうえご対応をお願いいたします。 ※今年度（令和８年度）新たに補助金の交付を希望する医療機関・薬局様へ 以下の詳細ページよりご申請をお願いいたします。 ■目的・概要 医療機関等がマイナンバーカードを公費負担医療及び地方単独医療費助成の受給者証として利用可能とするために実施するPMH（Public Medical Hub）接続に必要なシステム改修等に係る費用の一部を補助します。
受付の期間は、2026年7月15日から2027年3月31日まで。
| 制度名 | 【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金 |
|---|---|
| 実施機関 | 医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業 |
| 種類 | 補助金・助成金 |
| 対象地域 | 東京都 |
| 受付期間 | 2026年7月15日から2027年3月31日まで |
| 上限額 | 14万円 |
| 補助率・支援の内容 | 1/4 |
「【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金」でいくら支援されるか
【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金では、対象になる経費に対して25%が支援され、上限は14万円です。上限いっぱいを受けるには、対象と認められる経費が56万円必要です。これを下回る投資なら、上限に達する前に、補助率の分だけが支援されます。
対象経費（100%）／上限14万円（対象経費56万円で上限に到達）
| 対象経費 | 支援額の目安 | 自己負担 |
|---|---|---|
| 300万円 | 14万円 | 286万円 |
| 600万円 | 14万円 | 586万円 |
| 1,200万円 | 14万円 | 1,186万円 |
Q&A経営者の疑問に答える
Q. 【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金で、対象経費が600万円の場合、自己負担はいくらですか？
支援は14万円で、自己負担は586万円です。対象外の経費が混ざっていれば、その分は全額が自己負担に加わります。
「【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金」の対象になる方
対象になるかどうかを、この制度で定められている条件ごとに整理します。
- 1地域東京都
- 2対象者医療DX推進に向けた医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金交付
- 3対象の業種医療、福祉
- 4規模従業員数の制約は示されていません
| 確認すること | この制度の内容 |
|---|---|
| 地域 | 東京都 |
| 対象者 | 医療DX推進に向けた医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金交付要綱第４条のとおり |
| 対象の業種 | 医療、福祉 |
| 規模 | 従業員数の制約は示されていません |
| この制度の文章にある言葉 | ProdX Crowd編集部の見方 |
|---|---|
| 社会保険 | 従業員数や、雇用保険・社会保険への加入に関する条件があります。数え方（常勤・パートの扱い）は、制度の定義に従います。 |
「【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金」が目指していること
○過年度に補助金の交付を受けた医療機関・薬局様へ消費税及び地方消費税の仕入控除税額報告を受け付けております。手引き及び申請書類を本ページ最下部の「詳細」よりダウンロードのうえご対応をお願いいたします。※今年度（令和８年度）新たに補助金の交付を希望する医療機関・薬局様へ以下の詳細ページよりご申請をお願いいたします。医療機関等がマイナンバーカードを公費負担医療及び地方単独医療費助成の受給者証として利用可能とするために実施するPMH（Public Medical Hub）接続に必要なシステム改修等に係る費用の一部を補助します。
「【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金」の経費で気をつけたいこと
| この制度の文章にある言葉 | ProdX Crowd編集部の見方 |
|---|---|
| システム | システム・ソフトウェア・ウェブ関連の経費が含まれています。クラウドの月額利用料は「何か月分まで」と決められていることがあります。契約期間と補助事業の期間の関係を、見積もりの段階で確認します。汎用のパソコンやタブレットは対象外のことが多い点にも注意が必要です。この制度の補助率（25%）で考えると、この項目の見積額が100万円なら、支援の目安は25万円、自己負担は75万円です。 |
| 改修 | 工事・設置・施設整備に関する経費が含まれています。着工が交付決定の前だと対象外になる制度が多く、工事の写真（施工前・中・後）が証拠として求められます。天候や工期の遅れで期間内に終わらないリスクも、先に見ておきます。この制度の補助率（25%）で考えると、この項目の見積額が100万円なら、支援の目安は25万円、自己負担は75万円です。 |
補助率・金額の区分（この制度の定め）
| 区分 | 内容 |
|---|---|
| 金額 | ・病院：141,000円 ／ ・診療所、薬局：18,000円 |
申請の方法と、そろえる書類
| この制度の文章にある言葉 | ProdX Crowd編集部の見方 |
|---|---|
| 予算の範囲 | 予算の上限に達した時点で、受付が終了する可能性があります。受付の開始の直後に申請できるよう、書類を事前にそろえておきます。 |
「【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金」の手続きの流れと日程
この制度の受付は2026年7月15日から2027年3月31日まで。締切の2027年3月31日から逆算した、準備の目安は次の表のとおりです。
- 申請計画書・見積書を提出
- 審査1〜3か月
- 交付決定ここから発注できる
- 発注・実施期間内に支払いまで
- 実績報告証拠書類を提出
- 検査・確定補助額が決まる
- 入金お金が入るのは最後
発注・契約は「交付決定」の後。お金が入るのは、最後の「入金」です。
| 時期（目安） | やること |
|---|---|
| 2027年1月29日ごろ | 公募要領を読み、対象かどうかを確認する |
| 2027年2月13日ごろ | 見積書の依頼、電子申請のアカウント取得、決算書・納税証明書の準備 |
| 2027年2月28日ごろ | 事業計画書の作成を始め、第三者（商工会議所・よろず支援拠点など）にも見てもらう |
| 2027年3月23日ごろ | 書類の最終確認。入力を前倒しで済ませる |
| 2027年3月31日 | 受付の終了日。この日までに提出が完了していること |
似た取り組みの支援事例
この制度の目的に近いテーマで、当社が事業計画の整理を支援してきた事例です（企業が特定されないよう匿名化しています）。
| 事例 | 内容 |
|---|---|
| 切削工程の段取り負担を減らし、高精度・安定生産体制を目指す。 | CNC制御と工程の標準化で、高精度な製造体制を整える。 |
| ホテルリネンの乾燥・仕上げ工程を見直し、需要増に対応する生産体制へ。 | 乾燥工程の見直しで、仕上げ品質を保ちながら人手依存を改善。 |
| 機械検査と手動検査の2ラインを統合し、検査工程を再設計。 | 検査ラインの統合と自動化で、品質の安定と生産能力の向上を図る。 |
「【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金」についてのよくある質問
Q&A【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金
Q. 【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金の受付期間はいつですか？
2026年7月15日から2027年3月31日まで。
Q. 【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金は、いくらまで支援されますか？
上限は14万円です。対象経費に対して25%が支援されるため、56万円の対象経費で上限に達します。
Q. 【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金の対象になるのは、どんな事業者ですか？
医療DX推進に向けた医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金交付要綱第４条のとおり
この制度を検討するときの確認リスト
| 確認項目 | 状況 |
|---|---|
| 対象の地域（東京都）に、事業所がある | □ はい □ いいえ |
| 対象者の条件に当てはまる | □ はい □ いいえ |
| 受付期間（2026年7月15日から2027年3月31日まで）に間に合う | □ はい □ いいえ |
| 自己負担を、上限14万円・補助率25%で計算した | □ はい □ いいえ |
| 交付決定（または承認）の前に、発注・契約をしない | □ はい □ いいえ |
| 後払いの資金繰り（つなぎ資金）の目処が立っている | □ はい □ いいえ |
OFFICIAL DATA
制度の基本情報（公式データ）
- 制度名
- 【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金
- 実施機関
- 医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業
- 対象地域
- 東京都
- 募集開始日
- 2026/07/15 09:00
- 募集終了日
- 2027/03/31 23:59
- 補助上限額
- 14万円
- 補助率
- 1/4
- 対象（従業員数）
- 従業員数の制約なし
- 対象業種
- 医療、福祉
- 利用目的
- 設備整備・IT導入
- 対象者・対象経費
- 上の解説と、公募要領でご確認ください
Jグランツの掲載文（目的・概要・応募資格など）を見る
○過年度に補助金の交付を受けた医療機関・薬局様へ
消費税及び地方消費税の仕入控除税額報告を受け付けております。
手引き及び申請書類を本ページ最下部の「詳細」よりダウンロードのうえご対応をお願いいたします。
※今年度（令和８年度）新たに補助金の交付を希望する医療機関・薬局様へ
以下の詳細ページよりご申請をお願いいたします。
■目的・概要
医療機関等がマイナンバーカードを公費負担医療及び地方単独医療費助成の受給者証として利用可能とするために実施するPMH（Public Medical Hub）接続に必要なシステム改修等に係る費用の一部を補助します。
■根拠法令
医療DX推進に向けた医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金交付要綱
■応募資格
医療DX推進に向けた医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金交付要綱第４条のとおり
■地理条件
東京都内
■補助額上限
・病院：141,000円
・診療所、薬局：18,000円
■申請期限
令和９年２月26日
※予算の範囲内で実施する補助金のため、予算上限に到達した場合は申請期限より前に終了する可能性があります。
そのため、改修が完了し、申請書類がご準備できましたら、お早めの申請をお願いします。
※過年度の消費税及び地方消費税に係る仕入控除税額の報告は、令和８年９月30日が申請期限です。
■問合せ先
東京都マイナンバーカード利活用推進事業事務局
TEL：0120-979-850（土日祝日・年末年始を除く９時から17時まで）
■参照URL
東京都
医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業 特設ホームページ
https://pmh-hojokin2026.metro.tokyo.lg.jp
東京都デジタルサービス局ホームページ
母子保健オンラインサービス（PMH）
https://www.digitalservice.metro.tokyo.lg.jp/business/2030vision/kodomodx/pmh
厚生労働省
社会保険診療報酬支払基金 医療機関向け総合ポータルサイト
医療費助成のオンライン資格確認・マイナ診察券に係る助成金について
(医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業)
https://iryohokenjyoho.service-now.com/csm?id=kb_article_view&sysparm_article=KB0011504
問合せ先
オンライン資格確認等コールセンター 0800-080-4583（通話無料）
月曜日～金曜日（祝日を除く）8：00～18：00 土曜日（祝日を除く）8：00～16：00
Jグランツに掲載されている資料名を見る
- 補助金に係る消費税及び地方消費税の仕入控除税額報告の手引き20261007.pdf
- 補助金申請手続の手引き_20260917.pdf
- 医療DX推進に向けた医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業実施要綱.pdf
- 医療DX推進に向けた医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金交付要綱 .pdf
- 委任状（必要な場合のみ）.doc
- 【交付要綱（別記第１号様式別紙１）】別記第１号様式別紙１.xlsx
- 仕入控除税額に関する計算シート20260715.xlsx
募集期間
| 募集名 | 募集開始 | 募集終了 | 補助事業終了期限 |
|---|---|---|---|
| 令和８年度 | 2026/07/15 09:00 | 2027/03/31 23:59 | — |
出典：Jグランツ（デジタル庁）｜情報取得日時：2026/10/12 11:55
GUIDE
この制度を、くわしく読み解く
この制度の公式の案内文を、確認したい項目の順に整理しました。解釈や補足は、下の対話にまとめています。
目的・概要
○過年度に補助金の交付を受けた医療機関・薬局様へ
消費税及び地方消費税の仕入控除税額報告を受け付けております。
手引き及び申請書類を本ページ最下部の「詳細」よりダウンロードのうえご対応をお願いいたします。
※今年度（令和８年度）新たに補助金の交付を希望する医療機関・薬局様へ
以下の詳細ページよりご申請をお願いいたします。
公式の記載をすべて見る
○過年度に補助金の交付を受けた医療機関・薬局様へ
消費税及び地方消費税の仕入控除税額報告を受け付けております。
手引き及び申請書類を本ページ最下部の「詳細」よりダウンロードのうえご対応をお願いいたします。
※今年度（令和８年度）新たに補助金の交付を希望する医療機関・薬局様へ
以下の詳細ページよりご申請をお願いいたします。
医療機関等がマイナンバーカードを公費負担医療及び地方単独医療費助成の受給者証として利用可能とするために実施するPMH（Public Medical Hub）接続に必要なシステム改修等に係る費用の一部を補助します。
対象者・応募資格
医療DX推進に向けた医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金交付要綱第４条のとおり
東京都内
補助額・補助率
・病院：141,000円
・診療所、薬局：18,000円
問合せ先・参照先・根拠法令
問合せ先
東京都マイナンバーカード利活用推進事業事務局
TEL：0120-979-850（土日祝日・年末年始を除く９時から17時まで）
参照先
- https://pmh-hojokin2026.metro.tokyo.lg.jp
- https://www.digitalservice.metro.tokyo.lg.jp/business/2030vision/kodomodx/pmh
- https://iryohokenjyoho.service-now.com/csm?id=kb_article_view&sysparm_article=KB0011504
根拠
医療DX推進に向けた医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金交付要綱
対話で理解する
Q&A【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金について
Q. この補助金は、ひと言でいうとどんな制度ですか？
○過年度に補助金の交付を受けた医療機関・薬局様へ消費税及び地方消費税の仕入控除税額報告を受け付けております。手引き及び申請書類を本ページ最下部の「詳細」よりダウンロードのうえご対応をお願いいたします。
Jグランツでの利用目的の区分は、「設備整備・IT導入をしたい」です。
Q. いくらまで、どのくらいの割合で補助されますか？
Jグランツの掲載では、補助上限額は14万円、補助率は「1/4」です。
上限額や補助率は、申請する「枠」や事業者の区分によって異なる制度があります。自社が申請する枠の数字を、公募要領で確認します。
Q. いつまでに申請すればいいですか？
直近の募集は、2026/07/15〜2027/03/31です（現在募集中）。
締切の直前は電子申請が混み合うことがあるため、事業計画の準備は早めに始めます。
Q. うちの会社でも使えますか？
公式の記載では、「医療DX推進に向けた医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金交付要綱第４条のとおり東京都内」とされています。
Jグランツの検索項目では、従業員数：従業員数の制約なし ／ 地域：東京都 ／ 業種：医療、福祉です。
自社が対象かどうかの最終判断は公募要領の要件で決まります。迷う場合は、会社の規模・業種・やりたい取り組みを整理して相談するのが近道です。
Q. どんな費用が補助の対象になりますか？
対象経費はJグランツの掲載文には詳しく書かれていません。公募要領の「補助対象経費」「対象外経費」の章で確認します。
見積を取る前に確認しておくと、後から対象外と分かるリスクを減らせます。
Q. 申請は、どのように進めますか？
申請は公式ページ（Jグランツ）から公募要領を確認し、電子申請または事務局の指定する方法で行います。不明点は、掲載されている問合せ先に確認できます。
申請書類や加点項目は公募回ごとに変わることがあるため、必ず最新の公募要領を使います。
PLANNING ANALYSIS
この制度を事業計画に載せる前に考えること
ProdX Crowdの共通の検討フレームです。補助金は目的ではなく資金計画の一部として、「制度として対象になり得るか」と「その投資を行うべきか」を分けて考えます。制度固有の条件は、公募要領・実施機関の公式資料で確認してください。
A｜制度適合
制度として対象になり得るか
- 対象者（地域・業種・従業員数・事業者区分）
- 対象となる取り組みと、対象外の取り組み
- 対象経費・対象外経費、契約・発注・支払のルール
- 事業計画に求められる要件と、未達時の扱い
B｜事業合理性
その投資を会社として行うべきか
- 何を変えるのか（現状→制約→経営への影響）
- 変えると何が可能になるのか（能力・顧客価値）
- 数字にどう効くのか（基準値→目標値→年間効果）
- 補助金がなくても行う投資か
資金は回るか（Funding Stack）
投資総額 ＝ 自己資金 ＋ 融資 ＋ 補助金 ＋ 税制優遇 ＋ その他。上の公式情報にある補助率（1/4）・補助上限額（14万円）をもとに自己負担額を計算し、契約・支払の時期と補助金が入金される時期の差（運転資金・つなぎ資金）まで確認します。補助率が高くても、投資後にキャッシュを生まない設備なら合理的とは限りません。
7つの確認視点
| 視点 | 確認すること |
|---|---|
| 制度適合 | 対象者・対象事業・対象経費・要件に合うか（公募要領） |
| 事業合理性 | 課題・原因・必要な能力が整理され、投資の必要性を説明できるか |
| Before / After | 工程・業務が具体的にどう変わるか（ボトルネックはどこか） |
| KPI | 基準値・目標値・年間効果を、何で測るか |
| 資金 | 自己負担、融資、支払時期、入金時期、つなぎ資金 |
| 実行 | 人員・期間・発注・納期・資金で実行できるか |
| 投資本来の必要性 | 補助金がなくても行う投資か。行うなら時期はいつか |
ACTION PLAN
自社で確認すること
- 公募要領で、対象となる事業者の要件（地域・業種・従業員数など）を確認する
- 対象経費と、対象外の経費を確認する
- 募集期間と締切日時を確認する
- 交付決定前に発注・契約してよいかを確認する
- Jグランツで申請する場合は、GビズIDの準備状況を確認する
- 必要書類と、作成にかかる時間を見積もる
この利用目的の補助金で、一般的に確認したいこと
- 設備やITツールを発注・契約する前に、申請時期を確認しておきたい制度です。交付決定前に発注した経費を対象外とする補助金は多いため、公募要領で必ず確認してください。
- 補助金だけを理由に投資を決めるのではなく、投資効果も合わせて確認してください。
投資の内容・時期・金額を整理したうえで、この制度が自社に合うかを確認できます。利用できる制度を確認する
関連する補助金
関連する解説記事
関連する支援事例
よくある質問
【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金の受付期間はいつですか？
2026年7月15日から2027年3月31日まで。
【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金は、いくらまで支援されますか？
上限は14万円です。対象経費に対して25%が支援されるため、56万円の対象経費で上限に達します。
【令和８年度】医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金の対象になるのは、どんな事業者ですか？
医療DX推進に向けた医療機関等におけるマイナンバーカード利活用推進事業補助金交付要綱第４条のとおり